L’església romànica de Sant Miquel de Prats, declarada bé d’interès cultural, és un dels petits tresors arquitectònics més singulars i rurals de la parròquia de Canillo. Situat al poble de Prats, aquest temple, dels segles XII-XIII, destaca per la seva senzillesa i per una història fascinant marcada pel periple del seu retaule desaparegut.
El seu tret més característic és la seva adaptació a la topografia de l’alta muntanya. Construïda sobre un terreny amb fort pendent, gran part de l’absis i dels murs laterals de la nau queden mig soterrats per la terra, deixant completament lliure només la façana principal.
L’edifici presenta un esquema romànic molt simple: una sola nau rectangular de mides reduïdes (poc més de 9 metres de llargada) i un absis semicircular encarat a llevant. Els seus robusts murs d’un metre de gruix estan fets amb pedres de llicorella irregulars, conferint-li l’aspecte auster típic de l’arquitectura sacra rural andorrana. A la façana oest destaca el portal d’accés, emmarcat per dos arcs apuntats als quals s’accedeix pujant una petita escala de pedra, i un imponent campanar d’espadanya de dos ulls.
Durant segles, l’interior de l’església va estar presidit per un monumental retaule gòtic del segle XVI dedicat al seu patró, obra atribuïda a l’anomenat Mestre de Canillo. Tot i la seva riquesa artística, l’any 1926 el rector de la parròquia el va vendre per 15.000 pessetes de l’època. Aquesta venda va iniciar una autèntica odissea que el va portar fins a mans de col·leccionistes privats a Mallorca.
En les darreres dècades s’han aconseguit recuperar algunes de les peces originals disseminades, com la predel·la i la taula de La caiguda dels àngels rebels. Per seguir el procés de retornar a l’església la identitat que va perdre fa un segle, el Ministeri de Cultura i el Comú de Canillo han formalitzat un conveni per reproduir i reinstal·lar de forma fidedigna el retaule original del segle XVI a l’interior del temple. Coincidint amb el centenari de la seva venda el 1926, aquest projecte es durà a terme paral·lelament a unes obres de restauració geològica i estructural de l’edifici licitades aquest mateix any 2026.